工程南起一期工程終點灘頭站，北至遙墻機場站，主要沿機場路走行，全長約12.9km，共設車站5座，全線均采用地下敷設方式。

3號線二期工程連接空港組團、遙墻機場等客流集散點，與一期工程共同形成銜接中心城區和對外客運樞紐的重要線路。

西起小高莊站，東至董家鎮站，主要沿青島路、順安路、經十路、唐冶中路走行，全長約43.3km，共設車站32座，全線均采用地下敷設方式。

4號線是一條貫穿主城區的東西向骨干線，連接西客站片區、中心城區、CBD、唐冶片區等重點區域。

西起位里莊站，東至梁王東站，主要沿經一路、明湖西路、大明湖路、山大南路、鳳凰路走行，全長約39.1km，共設車站32座，全線均采用地下敷設方式。

6號線是一條貫穿主城區的東西向骨干線，連接濟南西站、濟南站、濟南東站三大對外交通樞紐，以及西客站片區、商埠區、CBD、王舍人片區、東站片區等重點區域。

南起章錦西站，北至新舊動能轉換先行區內行政中心站，主要沿旅游路、CBD中軸、花園路、歷山路、黃河以北先行區中軸走行，全長約37.3km，共設車站27座，均為地下站，過黃河段采用公軌合建高架敷設方式，其余部分采用地下敷設方式。

7號線一期工程是一條貫穿主城區的南北向骨干線，連接蓮花山片區、漢峪片區、CBD核心區、洪樓片區、黃臺片區、新舊動能轉換先行區等重點區域。

西起邢村站，東至山東大學站，沿經十東路走行，全長約21.9km，其中高架線14.5km，地下線7.4km。

設車站6座，其中高架車站3座，地下車站3座。8號線一期工程為中心城區至章丘的快線，線路連接唐冶片區、圣井片區等區域。

西起黃河南岸站，東至董家鎮站，沿勝利路、金輿大道、響泉路、鋼化路走行，全長約17.5km，共設車站12座，全線均采用地下敷設方式。

9號線一期工程為中心城區東北部骨干線，線路連接華山片區、王舍人片區等重點區域。

南起鋼城東站，北至山東大學站，主要沿鋼都大街、南外環路、鄂劉線、長勺南路、長勺北路、萊城大道、京滬高速公路走行，全長約89.3km，其中高架線83.9km，地下線1.1km，山嶺隧道4.3km。

設車站9座，其中高架車站8座，地下車站1座。S3線為連接中心城區與萊蕪的市域軌道交通線路，串聯濟南城區、萊城區、鋼城區及沿線城鎮。